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slurmstepd: error: Detected 12 oom-kill event(s) in StepId=22684181.0. Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler. srun: error: c04r4n38: task 30: Out Of Memory srun: launch/slurm: _step_signal: Terminating Ste...

这个错误信息表明你的作业在SLURM调度系统中由于内存不足(Out Of Memory, OOM)而被终止。具体来说,slurmstepd: error: Detected 12 oom-kill event(s)意味着在你的作业运行期间,有多个进程因为超出了分配的内存限制而被操作系统杀掉。

以下是一些可能的解决方案和建议:

  1. 增加内存请求:在提交作业时,可以请求更多的内存。例如,在srun或sbatch命令中使用--mem选项来增加所需的内存量。例如:

    sbatch --mem=8G my_job_script.sh
    
  2. 检查代码的内存使用情况:审查你的程序,确保没有内存泄漏或不必要的大数据结构。如果使用了大量的数据,请考虑对数据进行处理和优化。

  3. 减少并行进程数量:如果你正在使用多线程或并行处理,考虑降低并行进程数量,这样可以减少每个进程所需的内存。

  4. 监控资源使用情况:在运行作业之前,可以通过工具如tophtop或者SLURM提供的一些监控工具来观察当前节点上的资源使用情况,以确保有足够的可用内存。

  5. 优化算法或实现:如果可行的话,对算法进行优化以减少其内存占用,例如通过采用更高效的数据结构或算法设计。

  6. 联系管理员:如果无法自行解决问题,可以联系集群管理员,他们可能会提供更多关于如何配置集群环境的信息,以及其他用户可能遇到相同问题的解决方案。

根据具体情况,以上方法可能帮助你避免OOM事件,从而使得你的作业顺利完成。


内容由零声教学AI助手提供,问题来源于学员提问

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