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如何编写Lammps的in文件建立六方氮化硼模型

要建立六方氮化硼模型的Lammps输入文件,你需要按照以下步骤进行操作:

  1. 定义原子类型和相互作用势函数:在输入文件中定义原子类型,例如B和N,并选择适当的相互作用势函数。对于六方氮化硼,常用的是Tersoff势函数。
   # 设置元素类型
   atom_style atomic
   pair_style tersoff

   # 定义元素类型
   pair_coeff 1 1 B.tersoff B
   pair_coeff 2 2 N.tersoff N
  1. 创建盒子和晶格参数:设置仿真盒子的尺寸和晶格参数。
   # 设置盒子大小和形状(这里以a为基础)
   lattice custom a0 & 
       origin 0.0 0.0 0.0 & 
       basis 1 1 2.94 &    # B原子位置
             -1 -1 -2.94 & # N原子位置
             -3/2 -3/2 0

   region box block 0 ${lx} \
                   0 ${ly} \
                   {lz_lo} {lz_hi}
   
   create_box xhi xlo yhi ylo zhi zlo
   
   create_atoms random {nB} <region_id> &
                random {nN} <region_id>
                
   # 此处`lx`、`ly`、`lz_lo`、`lz_hi`分别表示x、y、z轴上的区域大小
   # `nB`和`nN`分别表示B和N原子的数量
  1. 设置初始速度和温度:为模拟设置合适的初始速度,并指定温度。
   velocity all create <temperature> 87287 loop geom

   # 此处<temperature>是期望的温度,87287是一个随机种子,geom选项使得粒子按照几何方式分配速度。
  1. 定义时间步长和总模拟步数:
   timestep <dt>
   
   run <total_steps>

   # 此处<dt>是时间步长,<total_steps>是总模拟步数。
  1. 设置输出参数:选择你感兴趣的输出参数(如能量、压力等)并将其写入日志文件中。

”` thermo_style custom step temp etotal press thermo_modify format float %.6f

dump dmp all atom

# 此处<dump_frequency>是转储频率,<dump_file_name>是转储文件名。
```

这只是一个基本框架示例,在实际使用中,你可能需要根据具体情况进行修改和优化。建议参考Lammps官方文档以及相关资料来进一步了解Lammps输入文件的编写方式。


内容由零声教学AI助手提供,问题来源于学员提问

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